Hậu duệ hiện đại của người Inca là một chủ đề mang tính tìm hiểu và nghiên cứu của nhiều nhà sử học trên thế giới. Đế quốc Inca là một nền văn minh rực rỡ thời kỳ Trung Cổ ở Nam Mỹ thuộc tây bán cầu với những con người, công trình, văn hóa và khoa học nổi tiếng của nền văn minh Inca nói riêng và cả thế giới nói chung. Khi đế quốc Tây Ban Nha tấn công nền văn minh Inca vào năm 1533 do Francisco Pizarro chỉ huy và bắt sống vua thứ 13 của đế quốc Inca là Atahualpa rồi sau đó xử tử ông thì cũng là thời điểm đế quốc Inca bắt đầu suy tàn nhanh chóng do sự tấn công của người Tây Ban Nha và sự lan truyền các bệnh dịch mà người Inca bản địa chưa từng tiếp xúc bao giờ nên không có khả năng miễn dịch. Sau khi Tây Ban Nha chinh phạt thành công nền văn minh Inca thì số lượng người Inca cũng bắt đầu giảm đi nhanh chóng. Theo một số tài liệu thì những người Inca cuối cùng biến mất vào đầu thế kỉ XVII nhưng theo một vài nhà sử học thì hoàn toàn không phải như vậy, rất có thể hậu duệ của người Inca ngày nay vẫn còn vì khi Tây Ban Nha thống trị toàn bộ đế quốc Inca nếu họ muốn sống sót thì phải che giấu thân phận thật sự của mình bằng cách tự nhận mình là người của các dân tộc da đỏ bản địa khác, sau này hậu duệ con cháu của họ mặc dù rất có thể là người Inca thực sự và thuần chủng nhưng do thời gian đã quá lâu nên những người này không còn biết được gốc gác thực sự của mình là ai, thuộc người dân tộc nào trong quá khứ nhưng nếu muốn tìm ra họ thì cũng rất khó khăn.